Y- प्रकार के आणविक sieves में हीरे के समान एक करीबी-पैक हेक्सागोनल संरचना है। यदि बीटा पिंजरे का उपयोग हीरे के कार्बन परमाणु नोड्स को बदलने के लिए संरचनात्मक इकाई के रूप में किया जाता है, और दो आसन्न बीटा पिंजरों को हेक्सागोनल स्तंभ पिंजरों के साथ जोड़ा जाता है, अर्थात, पांच बीटा पिंजरे चार हेक्सागोनल स्तंभ के साथ जुड़े होते हैं, जिनमें से एक बीटा केज केंद्र में स्थित होते हैं, जो कि शीर्ष पर स्थित होते हैं, क्रिस्टल संरचना बनती है। इस संरचना के साथ लिंक करना जारी रखने से, वाई-प्रकार आणविक छलनी संरचना प्राप्त की जाती है। इस संरचना में, and पिंजरे और हेक्सागोनल स्तंभ के पिंजरे द्वारा गठित बड़े पिंजरे एक आठ-तरफा ज़ियोलाइट पिंजरे हैं, और उनके इंटरलिंक्ड विंडो छेद बारह बाइनरी रिंग हैं, जिनके औसत प्रभावी छिद्र आकार 0.74nm हैं, जो कि Y-Type आणविकीय sieie का छिद्र आकार है। एक्स प्रकार आणविक छलनी और वाई प्रकार आणविक छलनी संरचना बिल्कुल समान है, लेकिन वाई प्रकार आणविक छलनी सिलिका एल्यूमीनियम अनुपात उच्च है, हाइड्रोथर्मल स्थिरता मजबूत है, इसलिए यह अधिक व्यापक रूप से उपयोग किया जाता है।
